Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3AQ14563 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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