Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
IKBKEQ14164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKBKEQ14164 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms