Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK13Q14004 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
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