Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CACNA1CQ13936 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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