Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR4Q13639 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR4Q13639 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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