Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PKD2Q13563 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKD2Q13563 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKD2Q13563 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
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