Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEUROD1Q13562 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEUROD1Q13562 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
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