Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGADQ13349 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGADQ13349 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGADQ13349 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGADQ13349 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGADQ13349 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGADQ13349 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms