Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKP2Q13309 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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SKP2Q13309 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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