Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN3Q13286 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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