Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF3Q13114 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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TRAF3Q13114 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
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TRAF3Q13114 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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TRAF3Q13114 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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TRAF3Q13114 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TRAF3Q13114 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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