Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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