Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN2Q12907 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMAN2Q12907 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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