Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFSWAPQ12872 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFSWAPQ12872 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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