Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RBBP4Q09028 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP4Q09028 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms