Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSC1Q08554 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSC1Q08554 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms