Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YNL203CYNL203C 612 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 PSF3YOL146W 585 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 MCA1YOR197W 1299 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 MCM16YPR046W 546 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 MFB1YDR219C 1398 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 PDR15YDR406W 4590 nt4.34□□□□□ -1.71
SGO1Q08490 UBP10YNL186W 2379 nt4.34□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 AKL1YBR059C 3327 nt4.34□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RAD28YDR030C 1521 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 snR84snR84 550 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SLU7YDR088C 1149 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YFL068WYFL068W 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RSR1YGR152C 819 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YJL007CYJL007C 315 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 LSO1YJR005C-A 282 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SRP21YKL122C 504 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 TPM1YNL079C 600 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 ECM32YER176W 3366 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 DSS1YMR287C 2910 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PIM1YBL022C 3402 nt4.33□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 GCD1YOR260W 1737 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 HOM3YER052C 1584 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 AGE1YDR524C 1449 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YER084W-AYER084W-A 513 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SAE3YHR079C-A 276 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YCL022CYCL022C 516 nt4.32□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PEX30YLR324W 1572 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 CDC37YDR168W 1521 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YJR038CYJR038C 363 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SDH3YKL141W 597 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLR257WYLR257W 966 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 GIM3YNL153C 390 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 POL30YBR088C 777 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 CTP1YBR291C 900 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 TDA1YMR291W 1761 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 MSK1YNL073W 1731 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 JHD2YJR119C 2187 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YMR221CYMR221C 1515 nt4.31□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 ZPR1YGR211W 1461 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PRS5YOL061W 1491 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 AIP1YMR092C 1848 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 CYM1YDR430C 2970 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 UBX3YDL091C 1368 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 ENP2YGR145W 2124 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PMC1YGL006W 3522 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PPH3YDR075W 927 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YDR157WYDR157W 402 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YDR491CYDR491C 492 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 MRP4YHL004W 1185 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YIL161WYIL161W 708 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 FBP1YLR377C 1047 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 FOL3YMR113W 1284 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RPS11BYBR048W 471 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YML020WYML020W 1995 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RAD1YPL022W 3303 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SPO23YBR250W 1572 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 GLO3YER122C 1482 nt4.3□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RGL1YPL066W 1440 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 ATG26YLR189C 3597 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SWC3YAL011W 1878 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RIM1YCR028C-A 408 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 RPL8AYHL033C 771 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YKR011CYKR011C 1062 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 SRP40YKR092C 1221 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 FYV7YLR068W 456 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 CDC42YLR229C 576 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YAR075WYAR075W 474 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YNL324WYNL324W 396 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 UTP23YOR004W 765 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YOR365CYOR365C 2112 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 KCC4YCL024W 3114 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 STB2YMR053C 2553 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 NTH1YDR001C 2256 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 AIM14YGL160W 1713 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 YLR152CYLR152C 1731 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 PFK1YGR240C 2964 nt4.29□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 CUE3YGL110C 1875 nt4.28□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 AEP3YPL005W 1821 nt4.28□□□□□ -1.72
SGO1Q08490 BCH2YKR027W 2298 nt4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms