Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP3CAQ08209 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP3CAQ08209 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms