Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPB1Q06547 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms