Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 SWD2YKL018W 990 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 GMH1YKR030W 822 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MSA2YKR077W 1092 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 PBA1YLR199C 831 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 SSN8YNL025C 972 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 RPL1AYPL220W 654 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 CDC40YDR364C 1368 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 SEC59YMR013C 1560 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MRH4YGL064C 1686 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 CYR1YJL005W 6081 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 DBP5YOR046C 1449 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 COP1YDL145C 3606 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 EXO5YBR163W 1758 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 ACA1YER045C 1470 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 RIM1YCR028C-A 408 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 OTU1YFL044C 906 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 KXD1YGL079W 657 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 REX3YLR107W 1215 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YAR075WYAR075W 474 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MRPS17YMR188C 714 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YPR136CYPR136C 513 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 UBP8YMR223W 1416 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 PFF1YBR074W 2931 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 RAX2YLR084C 3663 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YPL109CYPL109C 1974 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 GPI13YLL031C 3054 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 SMC2YFR031C 3513 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MED2YDL005C 1296 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 TGL2YDR058C 981 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 RAD55YDR076W 1221 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YGR026WYGR026W 837 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MRPS35YGR165W 1038 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YLR416CYLR416C 399 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 RSF1YMR030W 1131 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 HUB1YNR032C-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 PFK27YOL136C 1194 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YPL071CYPL071C 471 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 OXR1YPL196W 822 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YBR116CYBR116C 528 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MDM1YML104C 3384 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 MTC3YGL226W 372 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 AML1YGR001C 747 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YLR297WYLR297W 390 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YBL081WYBL081W 1107 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 HRT1YOL133W 366 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YOR263CYOR263C 408 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 SRB8YCR081W 4284 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 YTA7YGR270W 4140 nt2.9□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 KIN82YCR091W 2163 nt2.9□□□□□ -1.94
ATG17Q06410 CTH1YDR151C 978 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YIR014WYIR014W 729 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 RPC17YJL011C 486 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 MRPL49YJL096W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 IME1YJR094C 1083 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 HMX1YLR205C 954 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YPR203WYPR203W 309 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 PHO81YGR233C 3537 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 NMD2YHR077C 3270 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SAP1YER047C 2694 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 HIM1YDR317W 1245 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 HHF1YBR009C 312 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SIN4YNL236W 2925 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 CTM1YHR109W 1758 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 PCL2YDL127W 927 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 BSC2YDR275W 708 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 RRT13YER066W 558 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 TAM41YGR046W 1158 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 HHF2YNL030W 312 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 IAH1YOR126C 717 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 MRPL51YPR100W 423 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 AEP3YPL005W 1821 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 JSN1YJR091C 3276 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YGR067CYGR067C 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YDR340WYDR340W 303 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 GLG2YJL137C 1143 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 REC102YLR329W 795 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 CAF20YOR276W 486 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 snR34snR34 203 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 FLO11YIR019C 4104 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YDR355CYDR355C 303 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 RCE1YMR274C 948 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YOR385WYOR385W 873 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 REG2YBR050C 1017 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 NIP7YPL211W 546 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 PDC2YDR081C 2778 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 PRP8YHR165C 7242 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 TRM1YDR120C 1713 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 NOP4YPL043W 2058 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SHQ1YIL104C 1524 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YHL005CYHL005C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 RPL27AYHR010W 411 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 TDA8YAL064C-A 381 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 BLS1YLR408C 369 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SUR1YPL057C 1149 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 PHO88YBR106W 567 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 YSA1YBR111C 696 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 TRM12YML005W 1389 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 MYO5YMR109W 3660 nt2.84□□□□□ -1.95
ATG17Q06410 SPP382YLR424W 2127 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms