Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CALD1Q05682 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CALD1Q05682 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms