Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms