Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAV1Q03135 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAV1Q03135 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms