Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUCB1Q02818 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUCB1Q02818 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms