Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC3AQ02505 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC3AQ02505 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms