Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APBA1Q02410 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APBA1Q02410 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms