Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM2Q00987 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDM2Q00987 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms