Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP1Q00587 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms