Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDLBPQ00341 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDLBPQ00341 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms