Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD3P84022 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD3P84022 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms