Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX4P78413 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms