Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D2P62837 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms