Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL7AP62424 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms