Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms