Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2FP61218 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2FP61218 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms