Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EEFSECP57772 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EEFSECP57772 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms