Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIPK4P57078 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms