Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2BFSP57053 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms