Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX17P56962 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX17P56962 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX17P56962 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX17P56962 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STX17P56962 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX17P56962 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX17P56962 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX17P56962 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STX17P56962 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX17P56962 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX17P56962 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX17P56962 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX17P56962 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms