Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME5P56597 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME5P56597 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME5P56597 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NME5P56597 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME5P56597 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME5P56597 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME5P56597 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME5P56597 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME5P56597 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME5P56597 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME5P56597 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME5P56597 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms