Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTCP1P56278 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTCP1P56278 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms