Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52P55327 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52P55327 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52P55327 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52P55327 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52P55327 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52P55327 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52P55327 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms