Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCKAP1LP55160 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms