Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLTPP55058 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLTPP55058 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLTPP55058 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLTPP55058 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms