Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP98P52948 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP98P52948 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP98P52948 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP98P52948 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP98P52948 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP98P52948 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP98P52948 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms