Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF143P52747 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms