Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC3P51654 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC3P51654 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC3P51654 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC3P51654 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC3P51654 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC3P51654 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC3P51654 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms