Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A2P50993 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A2P50993 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms