Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GSK3BP49841 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms