Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP4P49662 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP4P49662 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms